Farnost sv. Mikuláše je jedna ze dvou farností, které dnes působí ve městě Znojmě, a její farní obvod zaujímá kromě historického jádra také Dolní Předměstí a okrajovou část Na Dyji.

Starobylé město Znojmo, sídlo údělných knížat z rodu Přemyslovců a později město královské, se stalo už v raném období významným centrem církevní správy. Již roku 1131 sem olomoucký biskup Jindřich Zdík umístil úřad jednoho ze šesti arcijáhnů na Moravě, od 13. století je doložena také existence jeho nižší územně správní jednotky, děkanství znojemského. První zpráva o románském kostele sv. Mikuláše pochází ze zakládací listiny louckého kláštera z roku 1190. V roce 1335 město zachvátil rozsáhlý požár, který těžce poničil i farní chrám. Jeho obnova trvala několik desítek let, výsledkem se stala prostorná a reprezentativní gotická trojlodní stavba, která daleko více odpovídala demografickému vývoji města. V 16. století se ve Znojmě usadili novokřtěnci a krátce nato ve městě převládlo učení luterské. Faru u sv. Mikuláše obsadili protestantští kazatelé a katolíci se museli uchýlit do kaple sv. Anny. O obnovu patronátního práva louckého kláštera ke kostelu sv. Mikuláše se zasloužil zejména jeho opat Šebestián Freitag z Čepirohu. V 18. století na vnitřní výzdobě kostela sv. Mikuláše pracovali přední barokní umělci – Josef Winterhalter a Franz Anton Maulbertsch. V roce 1836 musela být kostelní věž stržena a v následujících letech nahrazena věží novou. Územní obvod farnosti v rostoucím městě Znojmě byl josefinskými reformami upraven, když byla zřízena nová fara při kostele sv. Kříže, které připadla duchovní správa horní části města.

Nesmírně hodnotný farní archiv byl převzat do péče Státního okresního archivu ve Znojmě v roce 2002. Od roku 2013 je spravován Diecézním archivem Biskupství brněnského. Soubor 13 pergamenových listin z 15. a 16. století se vztahuje ke kostelním nadacím a k prezentacím jednotlivých oltářníků.

Nehyba, David: Farní úřad sv. Mikuláše Znojmo 1430-1969, Inventář, Znojmo 2003

Fila, K.: Chrám sv. Mikuláše ve Znojmě. Znojmo 1995

Hrudička, Alois: Topografie diecese brněnské, Brno 1908, s. 706-715

Peřinka, František Václav: Vlastivěda moravská II, Místopis Moravy. Znojemský okres. Musejní spolek v Brně, Brno 1904, s. 47-143

Průvodce chrámem sv. Mikuláše ve Znojmě a okolí. S. l., s. d.

Wolny, Gregor: Kirchliche Topographie von Mähren, meist nach Urkunden und Handschriften, Abtheilung 2, Brünner Diöcese, Band IV, Brünn 1861, S. 83-96