Do opuštěného kláštera minoritů byli jezuité povoláni v r. 1566, aby si zde vybudovali svou kolej. Fundační listinu koleje z r. 1570 potvrdil papež Řehoř XIII. v r. 1573. Ve stejném roce udělil císař Maxmilián II. jezuitské koleji práva vysokého učení. V r. 1581 byl při koleji zřízen papežský seminář, tzv. Collegium Nordicum, které mělo sloužit pro formaci kléru ze Skandinávie a východní Evropy. V první polovině 17. století museli jezuité kvůli válečným událostem kolej dvakrát opustit. Nový rozvoj pak spadá do druhé poloviny 17. století. V druhé polovině 18. století do fungování učení výrazně zasahoval stát, než došlo v r. 1773 ke zrušení jezuitského řádu.

Archiv koleje je dochován jen v torzovitém stavu, archiválií z fungování školy – první moravské univerzity – se dochovalo jen pár. Dohromady fond obsahuje 76 listin a 43 kartonů spisového materiálu.